整體內鏡洗消中心的主要功能是承接醫院可重復使用的硬式手術器械的清洗、消毒業務（金屬、橡膠、塑膠、高分子材料及其他硬質材料制造的手術器械、硬式內鏡等）清洗、消毒、干燥、檢查、包裝、滅菌、儲存、發放流水線。
整體內鏡洗消中心不包括醫療機構內部設置的消毒供應中心、消毒供應室和面向醫療器材生產經營企業的消毒供應機構。主要承擔醫療機構可重復使用的診療器械、器具、潔凈手術衣、手術蓋單等物品清洗、消毒、滅菌以及無菌物品供應。
對清洗手術硬器械（金屬、橡膠、塑膠、高分子材料及其他硬質材料制造的手術器械、硬式內鏡等）、清洗軟器械（可阻水、阻菌、透氣的手術衣、手術蓋單等，可穿戴、折疊的具有雙向防護功能的符合手術器械分類目錄的感染控制器械，不含普通醫用紡織品）、清洗軟式內鏡應配置的基本設備作了規定。
消毒軟式內鏡采用化學消毒劑進行消毒或者滅菌時，應當按照使用說明進行，并進行化學監測和生物學監測。需要消毒的內鏡采用酸性氧化電位水消毒，按使用說明操作。非全浸式內鏡的操作部，要用清水擦拭后再用75%乙醇擦拭消毒。需要滅菌的內鏡采用過氧化氫低溫等離子滅菌器滅菌。
清洗：
1、多酶洗液浸泡后的內鏡，用高壓水槍或者注射器沖洗各管箱中，使溫度升到100℃時，消毒5-10分鐘：用鍋加水煮沸后產道，以去除管道內的多酶洗液及松脫的污物，同時沖洗內鏡的外表面1分鐘。
2、用高壓氣沖向各管道沖氣10秒，排出管道內的水分，同時用清潔干紗布擦鏡表面，并清洗刷，清洗時間不少于1分鐘。
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